Phương pháp Kumon được thầy Toru Kumon sáng lập vào năm 1954 tại Osaka – Nhật Bản, với mục tiêu là giúp con trai của mình: anh Takeshi – khi đó đang học lớp 2 có thể cải thiện điểm toán ở trường, tiến nhanh nhất đến chương trình toán cấp 3 và hình thành các kỹ năng tính toán.

Kiên trì luyện tập với giáo trình do cha mình biên soạn, Takeshi đạt được kết quả thật bất ngờ, anh có thể giải được toán vi phân và tích phân tương đương với chương trình toán lớp 11 khi anh chỉ đang học lớp 6. Nhận thấy lợi ích từ phương pháp này và vì muốn chia sẻ lợi ích đến thật nhiều trẻ em khác nữa, năm 1958 thầy đã thành lập Viện Giáo Dục Kumon tại Osaka – Nhật Bản.